Pelatih John Herdman melakukan pergantian pemain pada awal babak kedua dengan memasukkan Ivar Jenner dan menarik keluar Ramadhan Sananta.
Bulgaria juga mengambil inisiatif untuk tampil lebih menyerang pada awal babak kedua. Pendekatan Bulgaria itu sempat menghasilkan peluang bagus untuk mereka, saat tendangan sudut gagal ditangkap dengan sempurna oleh kiper Emil Audero, bola kemudian mengarah ke Martin Minchev yang diteruskan dengan tembakan ke gawang yang kosong, sebelum bola itu dapat diblok oleh Justin Hubner.
Pada menit ke-58, Herdman kembali melakukan pergantian pemain. Kali ini ia memasukkan Elkan Baggott dan Eliano Reijnders, untuk menggantikan Nathan Tjoe-A-On dan Ragnar Oratmangoen.
Indonesia mendapat peluang bagus dari lemparan ke dalam panjang kiriman Kevin Diks, bola itu disambut sundulan membelakangi gawang oleh Elkan, bola mengarah ke gawang dan dapat dibuang pemain Bulgaria sebelum melewati garis gawang. Meski demikian, Elkan dianggap terlebih dahulu melakukan pelanggaran.
Pada menit ke-72, Indonesia kembali mendapat peluang bagus lainnya. Ole Romeny menerima bola panjang dari belakang, di kotak penalti ia mencungkil bola yang mengarah ke gawang, namun masih membentur mistar gawang.
Indonesia mencoba meningkatkan serangan pada fase akhir laga. Dony Tri Pamungkas masuk pada menit ke-73, dan ia hampir segera memberi dampak saat mengirim umpan silang ke mulut gawang yang masih mampu dibuang pemain Bulgaria. Tidak lama kemudian Indonesia memasukkan Beckham Putra Nugraha sebagai pemain pengganti.
